Khu Bảo tồn thiên nhiên (BTTN) Kẻ Gỗ không những có ý nghĩa về mặt đa dạng sinh học mà góp phần rất lớn trong bảo vệ môi trường, giảm nhẹ thiên tai, nghiên cứu khoa học, cung cấp nguồn nước sinh hoạt và sản xuất nông nghiệp, phát triển du lịch sinh thái ở Hà Tĩnh. Tuy nhiên, công tác bảo tồn thiên nhiên tại Khu BTTN Kẻ Gỗ đang đứng trước nhiều khó khăn, thách thức.