Tổng Cục đường bộ Việt Nam cũng yêu cầu Tổng công ty Sông Đà tăng cường công tác kiểm tra, giám sát việc thu phí, không để xảy ra hiện tượng tiêu cực trong quá trình chuẩn bị dừng thu tại trạm thu phí. Đồng thời, có trách nhiệm sắp xếp lao động và giải quyết chế độ cho người lao động khi tạm dừng thu phí. Tổ chức trông coi, bảo vệ bảo vệ tài sản trạm thu phí tránh mất mát, hư hỏng tài sản, thiết bị. Bên cạnh đó, có biện pháp đảm bảo an toàn giao thông khu vực trạm thu phí sau khi dừng thu phí.
Hầm đường bộ Đèo Ngang sẽ dừng thu phí để thanh quyết toán.
Đặc biệt, Tổng cục Đường bộ Việt Nam yêu cầu Tổng công ty Sông Đà khẩn trương cử cán bộ phối hợp với Tổng cục Đường bộ Việt Nam tính toán lại phương án tài chính (cập nhật số thu phí, các chi phí liên quan trong giai đoạn vận hành khai thác…) để xác định thời gian thu phí của dự án và quyết toán hợp đồng dự án.
Tổng công ty Sông Đà phải đẩy nhanh việc hoàn thiện các thủ tục để thực hiện xây dựng nâng cấp trạm thu phí theo tiêu chuẩn một dừng, không dừng theo quy định của Bộ GTVT. Đồng thời nộp số tiền thu thừa (nếu có) vào tài khoản do Tổng cục Đường bộ Việt Nam chỉ định. Ngoài ra, tiếp tục thực hiện công tác quản lý, bảo trì công trình đảm bảo vận hành thông suốt, an toàn và báo cáo Tổng Cục đường bộ Việt Nam kết quả thực hiện việc tạm dừng thu phí trước ngày 3-12-2016.
Tổng cục Đường bộ VN cũng giao các đơn vị thuộc Tổng cục thực hiện giám sát việc dừng thu phí tại trạm thu phí Đèo Ngang theo quy định; đàm phán, thương thảo ký kết phụ lục bổ sung, điều chỉnh hợp đồng dự án theo ủy quyền của Bộ GTVT; phối hợp với Tổng Công ty Sông Đà tính toán lại phương án tài chính, xác định thời gian thu phí của dự án và quyết toán hợp đồng dự án.
Trước đó, Bộ trưởng Bộ GTVT Trương Quang Nghĩa, đã yêu cầu đối với các dự án BOT hoàn thành và đã thu phí nhưng quá hạn chưa trình quyết toán dự án hoàn thành theo quy định thì cơ quan Nhà nước có thẩm quyền thì dừng thu phí cho đến khi nhà đầu tư trình quyết toán. Thời gian trình quyết toán nhà đầu tư tự chịu phần thiệt hại do dừng thu phí, nhà nước không bù thời gian thu phí trên.
