Nội dung thanh tra tập trung vào việc thực hiện, quản lý quy hoạch phát triển và xây dựng đầu tư chợ; phương án sử dụng điểm kinh doanh và bố trí sắp xếp ngành nghề kinh doạnh tại chợ; tổ chức bộ máy, sắp xếp lao động; công tác quản lý đầu tư, nâng cấp cải tạo, sửa chữa, duy tu bảo dưỡng các hạng mục công trình chợ, tổ chức thu nộp và quản lý, sử dụng các khoản thu tại chợ; vệ sinh môi trường, an toàn phòng chống cháy nổ.
Thời kỳ thanh tra từ năm 2005 đến nay (khi cần thiết có thể mở rộng thời kỳ trước đối với các nội dung có liên quan); thời gian thanh tra diễn ra trong 45 ngày làm việc.
Đoàn thanh tra có nhiệm vụ xây dựng, trình duyệt kế hoạch tiến hành thanh tra và tổ chức thực hiện các nội dung trên; báo cáo kết quả thanh tra và tham mưu UBND tỉnh kết luận thanh tra theo quy định của pháp luật.
Đoàn thanh tra được phép sử dụng con dấu của Thanh tra tỉnh trong quá trình hoạt động và tự giải thể khi hoàn thành nhiệm vụ.
